Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Cas curieux de variante de la triangle SARS-CoV-2 chez un crabot

Fin 2019, un coronavirus nouveau de syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) a apparu à Wuhan, Chine, et a jusqu'à présent depuis lors été des pandémies le plus économiquement impactful. Pendant que le monde entrait dans le lockdown, la recherche en matière de génétique moléculaire a familiarisé le public avec différentes mutations subies par (SARS-CoV-2).

Étude : Génome Proche-Complet de la variante de la triangle SARS-CoV-2 (AY.3) recensée chez un crabot au Kansas, Etats-Unis. Crédit d'image : Pyrstai/Shutterstock.com

Mouvement propre

La présence de ces mutations menées à certains d'entre eux étant marqués variantes d'intérêt (VOI), comme l'Eta (B.1.525), iota (B.1.526), et Kappa (B.1.617.1), selon des facteurs précédents. Comparativement, quelques tensions avec des mutations plus sérieuses ont été marquées comme variantes de préoccupation (VOC) comme l'alpha (B.1.1.7/Q), bêta (B.1.351.1, 2,3), triangle (B.1.617.2/AY), et (P.1.) variantes gamma. Prises ensemble, toutes ces variantes ont été classifiées sur la base de l'ordonnancement génomique, particulièrement lié aux régions codantes dans la protéine de la pointe (s) dans le génome SARS-CoV-2.

En dépit du transfert actuel des vaccins mondial, SARS-CoV-2 VOCs continuent à être caractérisés par transmissibility accru, plus de résultats de maladie sévère, réduction de neutralisation dans les personnes vaccinées, ou échecs dans le dépistage diagnostique.

Jusqu'à présent, la théorie de boîte de vitesses zoonotique était populaire ; cependant, la possibilité de la situation inverse dans laquelle la boîte de vitesses des êtres humains aux animaux s'est produite n'a pas été courante. Les recherches sur les réservoirs animaux potentiels de SARS-CoV-2, utilisant le virus originel de Chine, ont indiqué que les chats et les furets étaient permis au virus, alors que les crabots, les porcs, les poulets, et les canards étaient considérablement moins sensibles aux infections.

Cependant, les études sur la variante de triangle ont montré des hauts niveaux d'acide ribonucléique (ARN) et du rejet viral des hamsters et des lions asiatiques qui produisent doux pour modérer des signes cliniques. Là ont été des états d'isolement de la variante de triangle étant aussi bien isolée dans des crabots ; cependant, il y a un manque d'ordonnancer des caractéristiques du virus dans des hôtes canins.

Dans une étude récente, les chercheurs documentent le dépistage et l'ordonnancement d'un virus AY.3 d'un colley de 12 ans vivant avec un propriétaire de SARS-CoV-2-infected. L'animal a été admis au dispensaire vétérinaire de condition du Kansas (KSU VHC) pour des sympt40mes indépendants et a vérifié le positif pour SARS-CoV-2 par amplification en chaîne par polymérase de transcription inverse (RT-PCR) goujon-admission de deux jours.

Au sujet de l'étude

Un colley mâle de 12 ans a été admis à KSU VHC pour la course suivante s'effondrante. Le crabot a été diagnostiqué avec un hemo-abdomen secondaire à une masse splénique de purge vue sur une évaluation abdominal-orientée avec l'échographie pour l'échographie et l'abdominocentesis (RAPIDES) de traumatisme.

Les radiographies thoraciques ont montré une configuration pulmonaire alvéolaire multilobar avec une commande des vitesses médiastinale. Des diagnostics différentiels pour la pneumonie multilobar, l'atélectasie, ou l'hémorragie pulmonaire multifocale ont été conduits.

Une splénectomie a été exécutée le jour suivant l'admission, alors que des nodules hépatiques multifocales et un × 5 la masse de 4 (cm) centimètres sur le lobe médial gauche de foie étaient notés pendant la chirurgie. Oximetry pulmonaire exécuté après que la chirurgie ait été entre 88% et 90%, indiquant la perfusion faible ; pour cette raison le crabot a été renfermé dans une cage de l'oxygène du jour au lendemain. Les radiographies thoraciques ont montré les modifications pulmonaires compatibles avec la pneumonie graduelle d'aspiration et la dilatation des bronches cylindrique douce.

Le crabot a été relâché pendant 5 jours après admission sans condition pour l'oxygène supplémentaire. Le crabot est mort pendant deux jours après écoulement. Aucune autopsie ou essai auxiliaire n'a été réalisée. Le propriétaire avait vérifié le positif pour SARS-CoV-2 avant l'admission du crabot.

L'échantillon nasal d'écouvillon rassemblé de l'admission suivante de crabot au KSU VHC a été vérifié et a confirmé SARS-CoV-2-positive avec un Ct de 12,17 deux jours après admission. L'acide nucléique positif a été préparé pour l'entier-génome ordonnançant juste après la confirmation qRT-ACP.

Un total de 1.458.751 s'affiche ont été tracés au génome de référence. La séquence d'entier-génome obtenue à partir de l'échantillon de crabot a eu plusieurs changements précédemment non identifiés et seuls de niveau d'accord d'un génome SARS-CoV-2 qui pourrait avoir joué un rôle dans l'adaptation rapide des êtres humains aux crabots.

Une région codante SARS-CoV-2 complète et 5 un ′ partiel et 3 le ′ RNT ont été extraits des caractéristiques de ordonnancement profondes. Le génome était 29.884 nucléotides de longueur avec une teneur en CHROMATOGRAPHIE GAZEUSE de 38,0% et code 12 cadres de lecture ouverts des tailles prévues. Le génome était 99,96% identiques au prochain génome le plus proche (un échantillon interne, hCoV-19/USA/KS-KSU-2046/2021, GISAID# EPI_ISL_3693315) égalisant à 8 différences de nucléotide. De ces différences de nucléotide (4 dans ORF1 ; 2 dans S ; 1 en M ; 1 en N), trois modifications (NS) nonsynonymous (1 dans ORF1 ; 1 dans S ; 1 en N) étaient nouveau aux variantes de la triangle SARS-CoV-2 ordonnancées jusqu'ici.

En outre, 5/7 des variantes de subconsensus recensées dans la région codante de pointe dans la séquence de crabot ont été également recensés dans le cas humain de référence interne le plus proche. Prise ensemble, la séquence entière de génome, ainsi que les analyses variables phylogénétiques et de subconsensus, ont indiqué le virus infectant l'animal provenu d'un boîtier local de manifestation.

La cause du décès exacte n'était pas forcément COVID-19, car le crabot a eu un système immunitaire compromis lié aux masses hépatiques et spléniques, indépendamment de certains des sympt40mes COVID-19 classiques comme la pneumonie, la dilatation des bronches, et le manque d'oxygénation. L'ARN élevé charge dans l'écouvillon nasal a proposé que le crabot ait pu avoir jeté le virus, entraînant un risque d'infection aux personnes susceptibles dans les environs.

Implication

L'étude actuelle indique qu'il y avait une chance raisonnable du virus étant transmis de l'hôte à l'animal, bien que les raisons exactes de la mort demeurent discutables. Les séquences nouvelles trouvées dans la canine mettent l'accent sur l'importance des animaux familiers d'examen critique pour que COVID-19 réduise des débits de transmission dans la communauté environnante. Ces séquences pourraient très bien être des fils en recensant plus de variantes et leurs rôles dans les espèces différentes qu'elles infectent.

Journal reference:
Sreetama Dutt

Written by

Sreetama Dutt

Sreetama Dutt has completed her B.Tech. in Biotechnology from SRM University in Chennai, India and holds an M.Sc. in Medical Microbiology from the University of Manchester, UK. Initially decided upon building her career in laboratory-based research, medical writing and communications happened to catch her when she least expected it. Of course, nothing is a coincidence.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Dutt, Sreetama. (2021, November 01). Cas curieux de variante de la triangle SARS-CoV-2 chez un crabot. News-Medical. Retrieved on January 18, 2022 from https://www.news-medical.net/news/20211101/Curious-case-of-SARS-CoV-2-Delta-variant-in-a-dog.aspx.

  • MLA

    Dutt, Sreetama. "Cas curieux de variante de la triangle SARS-CoV-2 chez un crabot". News-Medical. 18 January 2022. <https://www.news-medical.net/news/20211101/Curious-case-of-SARS-CoV-2-Delta-variant-in-a-dog.aspx>.

  • Chicago

    Dutt, Sreetama. "Cas curieux de variante de la triangle SARS-CoV-2 chez un crabot". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20211101/Curious-case-of-SARS-CoV-2-Delta-variant-in-a-dog.aspx. (accessed January 18, 2022).

  • Harvard

    Dutt, Sreetama. 2021. Cas curieux de variante de la triangle SARS-CoV-2 chez un crabot. News-Medical, viewed 18 January 2022, https://www.news-medical.net/news/20211101/Curious-case-of-SARS-CoV-2-Delta-variant-in-a-dog.aspx.