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Caso curioso de la variante del delta SARS-CoV-2 en un perro

A finales de 2019, un coronavirus nuevo de la neumonía asiática (SARS-CoV-2) emergió en Wuhan, China, y tiene desde entonces hasta la fecha convertido de los pandémicos lo más económicamente posible impactful. Mientras que el mundo entró lockdown, la investigación de la genética molecular familiarizó el público con diversas mutaciones experimentadas por (SARS-CoV-2).

Estudio: Genoma Cercano-Completo de la variante del delta SARS-CoV-2 (AY.3) determinada en un perro en Kansas, los E.E.U.U. Haber de imagen: Pyrstai/Shutterstock.com

Fondo

La presencia de estas mutaciones llevadas a algunos de ellos etiqueta variantes del interés (VOI), como el Eta (B.1.525), iota (B.1.526), y Kappa (B.1.617.1), dependiendo de factores precedentes. Comparativamente, algunas deformaciones con mutaciones más serias etiqueta como variantes de la preocupación (VOC) como el alfa (B.1.1.7/Q), beta (B.1.351.1, 2,3), el delta (B.1.617.2/AY), y (P.1.) variantes gammas. Tomada juntos, todas estas variantes se han clasificado en base de la secuencia genomic, relacionada específicamente con las regiones de la codificación en la proteína del pico (s) dentro del genoma SARS-CoV-2.

A pesar del desarrollo actual de vacunas global, SARS-CoV-2 VOCs continúan ser caracterizados por transmisibilidad creciente, resultados más severos de la enfermedad, la reducción en la neutralización en individuos vacunados, o fallas en la detección diagnóstica.

Hasta la fecha, la teoría de la transmisión zoonótica era popular; sin embargo, la posibilidad de la situación reversa en la cual la transmisión de seres humanos a los animales ocurrió no ha sido común. Las investigaciones en depósitos animales potenciales de SARS-CoV-2, usando el virus original de China, indicaron que los gatos y los hurónes eran permisibles al virus, mientras que los perros, los lingotes, los pollos, y los patos eran considerablemente menos susceptibles a la infección.

Sin embargo, los estudios en la variante del delta han mostrado niveles del ácido ribonucleico (ARN) y del vertimiento viral de los hámsteres y de los leones asiáticos que producen suave para moderar signos clínicos. Tienen sido partes aislados de la variante del delta que es aislada de perros también; sin embargo, hay una falta de ordenar datos del virus en ordenadores principal caninos.

En un estudio reciente, los investigadores documentan la detección y la secuencia de un virus AY.3 de un collie de 12 años que vive con un propietario de SARS-CoV-2-infected. El animal fue admitido al centro de salud veterinario del estado de Kansas (KSU VHC) para los síntomas sin relación y probó el positivo para SARS-CoV-2 por la reacción en cadena de polimerasa de la reverso-transcripción (RT-PCR) poste-admisión de dos días.

Sobre el estudio

Un collie masculino de 12 años fue admitido a KSU VHC para el viaje de siguiente que se desplomaba. El perro fue diagnosticado con un hemo-abdomen secundario a una masa esplénica de la extracción de aire vista en una evaluación abdominal-enfocada con la sonografía para la exploración y el abdominocentesis (RÁPIDOS) del trauma.

Las radiografías torácicas mostraron una configuración pulmonar alveolar multilobar con un movimiento mediastínico. Las diagnosis del diferencial para la pulmonía multilobar, la atelectasia, o la hemorragia pulmonar multifocal conducto.

Un splenectomy fue realizado el día que seguía la admisión, mientras que los nódulos hepáticos multifocales y un × 5 masa de 4 (cm) centímetros en el lóbulo intermedio izquierdo del hígado fueron observados durante cirugía. Oximetry pulmonar realizada después de que la cirugía estuviera entre el 88% y el 90%, indicando la perfusión pobre; por lo tanto el perro fue contenido en una jaula del oxígeno durante la noche. Las radiografías torácicas mostraron los cambios pulmonares constantes con pulmonía progresiva de la aspiración y bronquiectasia cilíndrica suave.

El perro fue liberado 5 días después de la admisión sin el requisito para el oxígeno suplemental. El perro murió dos días después del licenciamiento. No se realizó ninguna autopsia o prueba ancilar. El propietario había probado el positivo para SARS-CoV-2 antes de la admisión del perro.

La muestra nasal del lampazo cerco de la admisión de siguiente del perro al KSU VHC fue probada y confirmó SARS-CoV-2-positive con un Ct de 12,17 dos días después de la admisión. El ácido nucléico positivo fue preparado para el entero-genoma que ordenaba inmediatamente después de la confirmación qRT-POLIMERIZACIÓN EN CADENA.

Un total de 1.458.751 lee fueron correlacionados al genoma de la referencia. La serie del entero-genoma obtenida de la muestra del perro tenía varios cambios previamente no identificados, únicos del nivel del consenso en un genoma SARS-CoV-2 que pudo haber desempeñado un papel en la adaptación rápida de seres humanos a los perros.

Una región completa de la codificación SARS-CoV-2 y 5 un ′ parcial y 3 el ′ UTRs fueron extraídos de los datos de secuencia profundos. El genoma era 29.884 nucleótidos de largo con un contenido de la CROMATOGRAFÍA GASEOSA de 38,0% y codifica 12 marcos de lectura abiertos de las tallas previstas. El genoma era 99,96% idénticos al genoma más cercano siguiente (una muestra interna, hCoV-19/USA/KS-KSU-2046/2021, GISAID# EPI_ISL_3693315) comparando a 8 diferencias del nucleótido. De estas diferencias del nucleótido (4 en ORF1; 2 en S; 1 en M; 1 en N), tres cambios (NS) nonsynonymous (1 en ORF1; 1 en S; 1 en N) era nuevo a las variantes del delta SARS-CoV-2 ordenadas hasta el momento.

Además, 5/7 de las variantes del subconsensus determinadas dentro de la región de la codificación del pico en la serie del perro también fue determinado en el caso humano interno más cercano de la referencia. Tomada junta, la serie entera del genoma, así como los análisis variables filogenéticos y del subconsensus, indicaron el virus que infectaba el animal originado de un atado local del brote.

La causa de la muerte exacta no era necesariamente COVID-19, pues el perro tenía un sistema inmune comprometido asociado a las masas hepáticas y esplénicas, aparte de algunos de los síntomas clásicos COVID-19 como pulmonía, bronquiectasia, y la falta de oxigenación. La alta carga del ARN en el lampazo nasal sugirió que el perro pudo haber vertido el virus, causando un riesgo de infección a los individuos susceptibles en los alrededores.

Implicación

El estudio actual indica que había una oportunidad justa del virus que era transmitido del ordenador principal al animal, aunque las razones exactas de la muerte siguen siendo discutibles. Las series nuevas encontradas en el colmillo acentúan la importancia de los animales domésticos de la investigación para que COVID-19 reduzca regímenes de transmisión en la comunidad circundante. Estas series podrían muy bien ser guías en determinar más variantes y sus papeles en la diversa especie que infectan.

Journal reference:
Sreetama Dutt

Written by

Sreetama Dutt

Sreetama Dutt has completed her B.Tech. in Biotechnology from SRM University in Chennai, India and holds an M.Sc. in Medical Microbiology from the University of Manchester, UK. Initially decided upon building her career in laboratory-based research, medical writing and communications happened to catch her when she least expected it. Of course, nothing is a coincidence.

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