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Infections de découverte de variante de la triangle SARS-CoV-2 parmi les membres du personnel soignant vaccinés

Les lignées génétiques des coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère ont limité les dégats en évoluant et en diffusant partout dans le monde. Parmi ces derniers, la variante B.1.617.2 (triangle) est la lignée la plus courante trouvée en Inde et mondial. De plus, des infections de découverte avec la variante de triangle ont été documentées dans les bénéficiaires vacciniques et les gens de COVID avec l'infection SARS-CoV-2 antérieure. Elle est peu claire si les personnes entièrement vaccinées avec deux doses du vaccin COVID-19 puissent transmettre le virus.

Après deux doses d'ARNm ou de vaccination basée sur adénovirus, l'efficacité vaccinique (VE) pour la variante de triangle est prévue pour être environ 50% pour l'infection symptomatique bénigne. Plus tôt, 155 cas des infections liées au vaccin avaient été documentés parmi des membres du personnel soignant de Delhi de ligne du front (HCW), dont la plupart avaient reçu un ou deux doses du vaccin de Covishield (ChAdOx1), et la majorité ont été immunisées les jours >21 avant l'exposé symptomatique.

Selon des caractéristiques existantes, les personnes vaccinées et non vaccinées ont les charges virales identiques, mais l'ancien groupe a obtenu un délabrement viral plus escarpé au fil du temps. En outre, la probabilité de la culture de virus était inférieure dans les personnes immunisées. Elle est peu claire si ceux qui ont une découverte vaccinique l'écartent en circuit à d'autres gens vaccinés ou si la boîte de vitesses est principalement conduite par les personnes non vaccinées.

Étude : Boîte de vitesses de variante de la triangle B.1.617.2 entre les membres du personnel soignant vaccinés. Crédit d
Étude : Boîte de vitesses de variante de la triangle B.1.617.2 entre les membres du personnel soignant vaccinés. Crédit d'image : NIAID

L'étude

Une étude neuve publiée sur les techniques in silico utilisées par serveur de prétirage de medRxiv*, combinant caractéristiques génomiques et épidémiologiques, pour déterminer des événements possibles de boîte de vitesses de Triangle-variante entre les membres du personnel soignant vaccinés (HCWs) dans les hôpitaux indiens.

Le modèle d'étude consisté en des membres du personnel soignant de ligne du front montrant des sympt40mes de SARS-CoV-2, qui ont été vérifiés pour la présence virale utilisant la réaction en chaîne inverse de transcriptase-polymérase (RT-PCR).

La bio-informatique et l'analyse phylogénétique a été effectuée en obtenant des séquences consensus dans le format de fasta de deux hôpitaux indépendants à Delhi, Inde.

Réseaux potentiels de boîte de vitesses entre HCWs. Différentes marques sont colorées selon l
Réseaux potentiels de boîte de vitesses entre HCWs. Différentes marques sont colorées selon l'état vaccinique, y compris le calage avant l'infection à laquelle le deuxième vaccin était donné, là où approprié. L'épaisseur des lignes entre les personnes montrent les probabilités par paires des événements distincts de boîte de vitesses entre les personnes ; ces probabilités sont fonction de la boîte de vitesses s'étant produit entre les personnes observées dans chaque réseau. Les marques montrent les dates relatives lesoù les personnes sont devenues symptomatiques, et les gains respectifs des nucléotides dans les séquences se sont rassemblés de chacun individuel en ce qui concerne l'accord mutuel.

Découvertes

Les résultats ont trouvé 81 infections de découverte parmi 1.100 HCWs dans l'hôpital A et 32 infections de découverte parmi 4.000 HCWs dans l'hôpital B.

B.1.617 a été trouvé dans 90,7% des infections de découverte dans HCWs doublement vacciné. B.1.1.7-like a représenté 5,3% du total, alors que B.1.538 a représenté 1,3%.

La fièvre (82.3 % de tous les cas), la toux (43.4 %), la myalgie (20,4%), et la perte de l'odeur/du goût (14.2 %) étaient les sympt40mes fréquemment rapportés. Dans l'hôpital A, 66 séquences ont produit la couverture de haute qualité d'entier-génome de plus de 90%, y compris 43 cas d'infection de découverte. Tandis que dans l'hôpital B, 52 échantillons, y compris chacune des 32 infections symptomatiques de découverte, ont été employés pour obtenir les séquences de haute qualité de génome.

Les introductions nombreuses dans les hôpitaux A et B se sont produites, avec la boîte de vitesses suivante d'intra-hôpital. Comme résultat, la segmentation significative de la phylogénie impliquée a été découverte, divisant les séquences en clades distincts.

Des mutations à l'accord de triangle qui ont été découvertes dans ces cas ont été trouvées partout au-dessus du génome SARS-CoV-2. Ni l'un ni l'autre du polymorphisme d'unique-nucléotide (SNPs) n'a été trouvé dans des endroits homoplasic du génome.

Notamment, les personnes 115, 127, et 305 dans l'hôpital A tout ont eu les génomes viraux identiques. De façon générale, 1.381 réseaux possibles de boîte de vitesses ont été identifiés dans l'hôpital A, et 128 réseaux probables de boîte de vitesses ont été recensés dans l'hôpital B, faisant participer le personnel médical différent.

Quand les caractéristiques étaient comparées aux simulations, on l'a constaté que le réseau de boîte de vitesses a impliqué pour l'hôpital A est cohérent. En revanche, le réseau impliqué pour l'hôpital B est potentiellement déformé par des caractéristiques manquantes, avec la plupart des personnes transportant de seules mutations. Une séquence courante de génome a été partagée par un membre junior de personnel médical, un stagiaire de soins, et un personnel infirmier à l'hôpital A - qui a développé la maladie plus de six jours tandis que trois autres membres de l'équipe avaient les génomes viraux qui ont différés de celui-ci un SNP unique. De plus, on a observé le remplacement nonsynonymous T3082I dans ORF1ab dans un membre junior de personnel médical.

La présente étude a deux oppositions significatives - premièrement, il a considéré seulement les patients symptomatiques, à l'exclusion d'asymptomatique ou des gens qui n'ont pas enregistré l'état d'infection. Deuxièmement, le nombre réduit d'échantillons admissibles a mené aux réseaux inachevés de boîte de vitesses.

Ensemble, les découvertes actuelles soulignent la possibilité de boîte de vitesses variable de triangle entre les personnes entièrement vaccinées dans un réglage de santé, en dépit de l'efficacité élevée des vaccins en évitant la maladie sévère. En outre, des infections de découverte ont été trouvées dans des réglages d'hôpital dans les gens moins de 60 jours du deuxième vaccin dose-quand les taux d'anticorps de neutralisation de diffusion étaient à leur crête.

Cette étude met en valeur l'importance des mesures de contrôle prolongées d'infection, même dans les populations hautement vaccinées, et l'utilisation de masque dans les personnes qui ont reçu deux doses de vaccination pour réduire la boîte de vitesses en avant.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Nidhi Saha

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Nidhi Saha

I am a medical content writer and editor. My interests lie in public health awareness and medical communication. I have worked as a clinical dentist and as a consultant research writer in an Indian medical publishing house. It is my constant endeavor is to update knowledge on newer treatment modalities relating to various medical fields. I have also aided in proofreading and publication of manuscripts in accredited medical journals. I like to sketch, read and listen to music in my leisure time.

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