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Infecções da descoberta da variação do delta SARS-CoV-2 entre trabalhadores vacinados dos cuidados médicos

As linhagens genéticas do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) wreaked dano evoluindo e circulando pelo mundo inteiro. Entre estes, (delta) a variação B.1.617.2 é a linhagem a mais comum encontrada na Índia e global. Além, as infecções da descoberta com variação do delta foram documentadas em receptores vacinais e em povos de COVID com a infecção SARS-CoV-2 prévia. É obscura se os indivíduos inteiramente vacinados com duas doses da vacina COVID-19 podem transmitir o vírus.

Depois que duas doses do mRNA ou da vacinação vírus-baseada, eficácia vacinal (VE) para a variação do delta são previstas para ser ao redor 50% para a infecção sintomático suave. Mais cedo, 155 casos de infecções vacina-relacionadas tinham sido documentados entre os trabalhadores dos cuidados médicos de Deli da linha da frente (HCW), a maioria de quem tinha recebido uma ou dois doses da vacina de Covishield (ChAdOx1), e a maioria foi imunizada os dias >21 antes da apresentação sintomático.

De acordo com indivíduos vacinados e unvaccinated dos dados existentes, tenha cargas virais idênticas, mas o grupo anterior induziu uma deterioração viral mais íngreme ao longo do tempo. Também, a probabilidade da cultura do vírus era mais baixa em indivíduos imunizados. É obscura se aquelas que têm uma descoberta vacinal a espalham sobre a outros povos vacinados ou se a transmissão é conduzida primeiramente pelos indivíduos unvaccinated.

Estudo: Transmissão da variação do delta B.1.617.2 entre trabalhadores vacinados dos cuidados médicos. Crédito de imagem: NIAID
Estudo: Transmissão da variação do delta B.1.617.2 entre trabalhadores vacinados dos cuidados médicos. Crédito de imagem: NIAID

O estudo

Um estudo novo publicado nas técnicas in silico empregadas server da pré-impressão do medRxiv*, combinando dados genomic e epidemiológicos, para determinar eventos possíveis da transmissão da Delta-variação entre trabalhadores vacinados dos cuidados médicos (HCWs) em hospitais indianos.

O projecto do estudo compreendido dos trabalhadores dos cuidados médicos da linha da frente que exibem sintomas de SARS-CoV-2, que foram testados para a presença viral usando a reacção em cadeia reversa da transcriptase-polimerase (RT-PCR).

A bioinformática e a análise filogenética foram realizadas obtendo seqüências de consenso no formato do fasta de dois hospitais separados em Deli, Índia.

Redes potenciais da transmissão entre HCWs. As etiquetas individuais são coloridas de acordo com o estado vacinal, incluindo o sincronismo antes da infecção em que a segunda vacina foi dada, onde relevante. A espessura das linhas entre indivíduos mostra as probabilidades por pares de eventos distintos da transmissão entre indivíduos; estas probabilidades são condicionais na transmissão que ocorre entre os indivíduos observados em cada rede. As etiquetas mostram as tâmaras relativas em que os indivíduos se tornaram sintomáticos, e os ganhos respectivos dos nucleotides nas seqüências recolheram de cada um individual no que diz respeito ao consenso mútuo.
Redes potenciais da transmissão entre HCWs. As etiquetas individuais são coloridas de acordo com o estado vacinal, incluindo o sincronismo antes da infecção em que a segunda vacina foi dada, onde relevante. A espessura das linhas entre indivíduos mostra as probabilidades por pares de eventos distintos da transmissão entre indivíduos; estas probabilidades são condicionais na transmissão que ocorre entre os indivíduos observados em cada rede. As etiquetas mostram as tâmaras relativas em que os indivíduos se tornaram sintomáticos, e os ganhos respectivos dos nucleotides nas seqüências recolheram de cada um individual no que diz respeito ao consenso mútuo.

Resultados

Os resultados encontraram 81 infecções da descoberta entre 1.100 HCWs no hospital A e 32 infecções da descoberta entre 4.000 HCWs no hospital B.

B.1.617 foi encontrado em 90,7% das infecções da descoberta em HCWs dobro vacinado. B.1.1.7-like esclareceu 5,3% do total, visto que B.1.538 esclareceu 1,3%.

A febre (82.3% de todos os casos), a tosse (43.4%), o myalgia (20,4%), e a perda do cheiro/gosto (14.2%) eram os sintomas freqüentemente relatados. No hospital A, 66 seqüências produziram a cobertura de alta qualidade do inteiro-genoma de mais de 90%, incluindo 43 casos da infecção da descoberta. Quando no hospital B, 52 amostras, incluindo todas as 32 infecções sintomáticos da descoberta, foram usadas para obter as seqüências de alta qualidade do genoma.

As introduções numerosas nos hospitais A e B ocorreram, com a transmissão subseqüente do intra-hospital. Em conseqüência, a divisão significativa da filogenia pressupor foi descoberta, dividindo as seqüências em clades distintos.

As mutações ao consenso do delta que foram descobertas nesses casos foram detectadas em toda parte sobre o genoma SARS-CoV-2. Nenhum do polimorfismo do único-nucleotide (SNPs) foi encontrado em áreas homoplasic do genoma.

Notàvel, os indivíduos 115, 127, e 305 no hospital A todo tiveram genomas virais idênticos. Totais, 1.381 redes possíveis da transmissão foram reconhecidas no hospital A, e 128 redes prováveis da transmissão foram identificadas no hospital B, envolvendo o pessoal médico diferente.

Quando os dados foram comparados às simulações, encontrou-se que a rede da transmissão pressups para o hospital A é auto-consistente. Ao contrário, a rede pressupor para o hospital B é distorcida potencial por dados faltantes, com a maioria de indivíduos que levam mutações originais. Uma seqüência comum do genoma foi compartilhada por um membro do pessoal médico júnior, por um estudante dos cuidados, e por um pessoal de cuidados no hospital A - quem desenvolveu a doença sobre seis dias quando outros três membros da equipa tiveram os genomas virais que diferiram deste um único SNP. Além, a substituição nonsynonymous T3082I em ORF1ab foi observada em um membro do pessoal médico júnior.

O estudo actual tem duas advertências significativas - em primeiro lugar, ele considerou somente pacientes sintomáticos, com exclusão de assintomático ou dos povos que não relataram o estado da infecção. Em segundo lugar, o número reduzido de amostras válidas conduziu às correntes incompletas da transmissão.

Junto, o relevo actual dos resultados a possibilidade de transmissão variante do delta entre indivíduos inteiramente vacinados em um ajuste dos cuidados médicos, apesar da eficácia alta das vacinas em impedir a doença severa. Além disso, as infecções da descoberta foram detectadas em ajustes do hospital nos povos no prazo de 60 dias da segunda vacina dose-quando os níveis de neutralização de circulação do anticorpo estavam em seu pico.

Este estudo destaca a importância de medidas de controle continuadas da infecção, mesmo em populações altamente vacinadas, e o uso da máscara nos indivíduos que receberam duas doses da vacinação para reduzir a transmissão para a frente.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Nidhi Saha

Written by

Nidhi Saha

I am a medical content writer and editor. My interests lie in public health awareness and medical communication. I have worked as a clinical dentist and as a consultant research writer in an Indian medical publishing house. It is my constant endeavor is to update knowledge on newer treatment modalities relating to various medical fields. I have also aided in proofreading and publication of manuscripts in accredited medical journals. I like to sketch, read and listen to music in my leisure time.

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