O projecto humano de Metabolome

Metabolomics é o estudo do metabolome, um número que seja caracterizado como um grupo completo de ponto baixo - metabolitos do peso molecular actuais nas pilhas, nos tecidos, nos líquidos biológicos, ou no corpo.

Comparado à genómica e ao proteomics, o metabolomics é um campo relativamente novo, e muitas tentativas foram feitas, e ainda estão emergindo, para esboçar eficazmente a encenação metabólica completa de organismos vivos.

Desde que as concentrações e as actividades dos metabolitos são reguladas a níveis (proteomic) transcricionais (genomic) e translational, o metabolomics é considerado como meios eficientes de converter mudanças genomic e proteomic nos fenótipos celulares particulares, que são visíveis nos olhos nus.

Por este motivo, o metabolomics está transformando-se um requisito principal para muitos campos independentemente do ensino geral, incluindo o ajuste dos cuidados médicos, as indústrias farmacêuticas, a química clínica, as experimentações pré-clínicas, e a toxicologia.

Ao contrário do genoma humano, que é arranjado em seqüência agora inteiramente e livremente disponível, o metabolomics está ainda em sua fase tornando-se.

Uma dificuldade principal em calcular metabolitos é que o número de metabolitos não está mesmo em todos os tecidos, porque cada tecido serve funções metabólicas diferentes.

Além, a concentração de metabolitos não é constante e não se mantem mudar de um ponto do tempo a outro, segundo a procura metabólica do corpo. Apesar destes obstáculos, muitos esforços bem sucedidos foram feitos para recrutar um número evergrowing de metabolitos.

O projecto humano de Metabolome

O projecto de Metabolome do ser humano (HMP) é uma tentativa que seja empreendida ajudar à pesquisa do metabolomics.

Lançado em janeiro de 2005 e financiado pelo genoma Canadá, os objetivos principais $7,5 milhões do projecto HMP incluem: melhoria na identificação, no prognóstico, e na monitoração da doença; avaliação do metabolismo e da toxicologia da droga; criando uma relação entre o metabolome humano e o genoma humano; e a revelação de um software para o metabolomics.

O projecto é primeiramente identificação visada, determinação, índice, e armazenagem de todos os metabolitos que poderiam ser encontrados no corpo humano nas concentrações maiores de 1 micromolar.

O projecto igualmente apontou criar uma base de dados humana de Metabolome, uma base de dados eletrônica, para fazer livremente os dados disponíveis a todos os pesquisadores.

Além, HMP igualmente aponta criar uma biblioteca humana de Metabolome para fazer publicamente todos os compostos - disponíveis.

Assim, o foco preliminar de HMP é fornecer dados químicos e compostos químicos à comunidade científica para sua utilização na pesquisa e na universidade; contudo, o projecto não é pretendido para a utilização de tais compostos químicos para a identificação e a caracterização da doença.

A base de dados humana de Metabolome

A base de dados de Metabolome do ser humano (HMDB) é uma base de dados eletrônica livre-acessível que combina a bioinformática, a informática química, e a informática médica.

A base de dados contem a informação na concentração e a estrutura do metabolito, enzimas ou transportadores associados, propriedades fisiológicos e doença-relacionadas, e caminhos relacionados do reacção química e os metabólicos.

A versão a mais atrasada da base de dados, HMDB 4,0, igualmente inclui dados espectrais de uma referência de um grande número MS/MS previstos (espectrometria em massa) e de GC-MS (espectrometria da cromatografia-massa do gás) e previu estruturas do metabolito para facilitar a identificação de metabolitos novos.

Além, a informação em metabolito-únicas interacções do polimorfismo do nucleotide e o efeito das drogas no metabolito concentração-são incluídos igualmente.

Presentemente, HMDB inclui detalhes de 114.100 conhecidos, metabolitos previstos, e previstos. Além, contem ressonância magnética nuclear experimental medida e computacional-prevista (NMR), de referência de MS/MS, e de GC-MS dados dos espectros de 351.754 metabolitos; detalhes metabólicos do caminho de 25.700 metabolitos; e detalhes de 5.498 metabolitos que são associados com as circunstâncias doentes.

De acordo com a base de dados, o número de metabolitos no soro humano, a urina, o líquido cerebrospinal, a saliva, o suor, e a fezes são 25.424, 4.225, 440, 1.234, 90, e 1.170, respectivamente.

Fontes

[Leitura adicional: Metabolomics]

Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Sanchari Sinha Dutta

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Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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