El proyecto humano de Metabolome

Metabolomics es el estudio del metabolome, un número se caracterice que mientras que un equipo completo de metabilitos de poco peso molecular presenta en las células, los tejidos, los líquidos biológicos, o la carrocería.

Comparado a la genómica y al proteomics, el metabolomics es relativamente un nuevo campo, y muchas tentativas se han hecho, y todavía están emergiendo, para contornear efectivo el decorado metabólico completo de organismos vivos.

Puesto que las concentraciones y las actividades de metabilitos se regulan en los niveles (proteomic) transcriptivos (genomic) y de translación, el metabolomics se considera como los medios eficientes de convertir cambios genomic y proteomic en los fenotipos celulares determinados, que son visibles en aros descubiertos.

Por este motivo, el metabolomics se está convirtiendo en un requisito primero para muchos campos aparte de la educación general, incluyendo la fijación de la atención sanitaria, las industrias farmacéuticas, la química clínica, las juicios preclínicas, y la toxicología.

A diferencia del genoma humano, que ahora se ordena completo y libremente disponible, el metabolomics todavía está en su escenario que se convierte.

Una dificultad importante en el cálculo de los metabilitos es que el número de metabilitos no está lo mismo en todos los tejidos, pues cada tejido sirve diversas funciones metabólicas.

Además, la concentración de metabilitos no es constante y no guarda el cambiar a partir de un punto del tiempo a otro, dependiendo de la demanda metabólica de la carrocería. A pesar de estos obstáculos, se han hecho muchos esfuerzos acertados de alistar un número cada vez mayor de metabilitos.

El proyecto humano de Metabolome

El proyecto de Metabolome del ser humano (HMP) es una tentativa que se ha emprendido para ayudar a la investigación del metabolomics.

Lanzado en enero de 2005 y financiado por el genoma Canadá, los objetivos principales $7,5 millones del proyecto HMP incluyen: mejoría en la identificación, el pronóstico, y la supervisión de la enfermedad; evaluación del metabolismo y de la toxicología de la droga; establecer relaciones entre el metabolome humano y el genoma humano; y el revelado de un software para el metabolomics.

El proyecto es sobre todo determinar dirigido, cuantificación, dividir, y salvar de todos los metabilitos que se podrían encontrar en el cuerpo humano en las concentraciones mayores de 1 micromolar.

El proyecto también apuntó crear una base de datos humana de Metabolome, una base de datos electrónica, para poner los datos libremente a disposición todos los investigadores.

Además, HMP también apunta crear una biblioteca humana de Metabolome para hacer todas las composiciones público - disponibles.

Así, el foco primario de HMP es ofrecer datos químicos y composiciones químicas a la comunidad científica para su utilización en la investigación y la universidad; sin embargo, el proyecto no se piensa para la utilización de tales composiciones químicas para la identificación y la caracterización de la enfermedad.

La base de datos humana de Metabolome

La base de datos de Metabolome del ser humano (HMDB) es una base de datos electrónica libre-accesible que combina la bioinformática, la informática química, y la informática médica.

La base de datos contiene la información sobre la concentración y estructura del metabilito, las enzimas o los transportadores asociados, las propiedades fisiológicas y enfermedad-relacionadas, y los caminos químicos relacionados del reacción y metabólicos.

La última versión de la base de datos, HMDB 4,0, también incluye los datos espectrales de una referencia de un gran número de MS/MS previstos (espectrometría de masa) y de GC-MS (cromatología gaseosa-espectrometría de masa) y predijo las estructuras del metabilito para facilitar la identificación de metabilitos nuevos.

Además, la información sobre metabilito-únicas acciones recíprocas del polimorfismo del nucleótido y el efecto de drogas sobre el metabilito concentración-también se incluyen.

Actualmente, HMDB incluye los detalles de 114.100 conocidos, previstos, y previstos metabilitos. Además, contiene los datos de resonancia magnética, de MS/MS, y (NMR) de GC-MS nucleares experimental medidos y de cómputo-previstos de la referencia de los espectros de 351.754 metabilitos; detalles metabólicos del camino de 25.700 metabilitos; y detalles de 5.498 metabilitos que se asocian a condiciones enfermas.

Según la base de datos, el número de metabilitos en suero humano, la orina, el líquido cerebroespinal, la saliva, el sudor, y las heces son 25.424, 4.225, 440, 1.234, 90, y 1.170, respectivamente.

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Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Sanchari Sinha Dutta

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Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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