Ved Dr. Ananya Mandal, MD
RNA er et enkelt strandede molekyle indeholdende en ribose sukker. Den har en karakteristisk struktur, og i modsætning til DNA, der er variationer og forskellige typer RNA strukturer.
Den grundlæggende struktur af RNA
Den grundlæggende struktur af RNA, dog kan skitseres i en ribose sukker, der er nummereret fra 1' gennem 5', med:
- en base, der er knyttet til stillingen 1'
- en hydroxyl gruppe på position 2'
- en fosfat, der er knyttet til 3' stilling en ribose og 5'-position af næste
Ribonukleinsyre (RNA) har baser adenin (A), cytosin (C), guanin (G) og uracil (U). Billede kredit: National Institute of General Medical Sciences
RNA baser
En base er knyttet til 1' stillingen generelt adenin (A), cytosin (C), guanin (G) eller uracil (U).
Adenin og guanin er purines; cytosin og uracil er pyrimidines. Baserne kan danne hydrogen bonds mellem cytosin og guanin, mellem adenin og uracil og mellem guanin og uracil.
I modsætning til DNA, der indeholder kun fire baser A, T, G og C, kan modent RNA indeholde modificerede baser og sukker.
Pseudouridine (også), hvor en sammenkædning mellem uracil og ribose ændres fra en C–N obligation til en C–C bond og ribothymidine (T), der findes i forskellige steder. En anden bemærkelsesværdig ændrede base er hypoxanthine, en deaminated adenin base hvis Nukleosid kaldes Inosin, (I).
RNA hydroxyl gruppe
Der er tilstedeværelsen af et hydroxyl gruppe på position 2' ribose sukker. Dette gør RNA forskellige fra DNA og gør RNA vedtage en A-form geometri snarere end B-form mest almindeligt observerede i DNA. Det betyder, at der er en meget dyb og smal store groove og en smal og bred mindre groove.
Hydroxyl-gruppe på 2' betyder, at kemikalier i et RNA-molekyle fleksible regioner kan angribe de tilgrænsende phosphodiester bond for at kløve rygraden.
RNA fosfat gruppen
En fosfat gruppen er tilknyttet 3' stilling en ribose og 5'-position af næste.
Fosfat-grupper har en negativ ladning. Dette gør RNA et opladet molekyle (polyanion).
RNA tertiære struktur
Når RNA er dannet, ligesom proteiner kræver det skal undergå ændringer for at danne en specifik tertiære struktur. Scaffold for denne struktur tilbydes af sekundære strukturelle elementer, som er hydrogen bonds i molekylet. The strand danner hårnål loops, buler og indre løkker. Da RNA er opladet, metal-ioner som Mg2 + er nødvendige for at stabilisere mange sekundære og tertiære strukturer.
RNA tertiære strukturer bestemmes ved hjælp af kemiske test og modifikation indblanding mapping, Kernemagnetisk resonans (NMR), Røntgenkrystallografi og cryo-electron microscopy.
Gennemgået af April Cashin-Garbutt, BA Hons (Cantab)
Kilder
- http://Biology.Kenyon.edu/Courses/biol63/watson_06.PDF
- http://www.Biology.Creative-Chemistry.org.uk/Documents/N-bio-06.PDF
- http://www.liver-EG.org/includes/lectures/bio/RNA.PDF
- http://www.saylor.org/site/wp-content/uploads/2010/11/BIO101-DNA-vs-RNA.PDF
- http://RNA.cshl.edu/content/Free/chapters/04_rna_world_2nd.PDF
- http://SMB.slac.Stanford.edu/~ASH/nsb_genomics/011_doudna_rna.PDF
Yderligere lµsning